| 學術專書 |
| 1. | 2000 | 《中國現代學人的學術性格與思維方式論集》（台北：五南） |
| 2. | 1996 | 《分流教育的改革：理論、實務與對策》（與黃俊傑、陳昭瑛合著；台北：行政院教育改革審議委員會） |
| 3. | 1993 | Western Rationalism and the Chinese Mind: Counter-Enlightenment and Philosophy of Life in China, 1915-27,（Yale University Ph. D. Dissertation, Michigan University Microfilm） |
| 4. | 1985 | 〈朱子理學與史學研究〉（國立台灣大學碩士論文） |
| 編譯書 |
| 參考書 |
| 期刊論文 |
| 1. | 2004.06 | 〈聖人之書與天理的普遍性：論朱子的經典詮釋之前提假設〉《臺大歷史學報》第三十三期（2004，台北） |
| 2. | 2000.10 | 〈孔子思想與現代世界新論〉，《錢穆先生紀念館館刊》（台北） |
| 3. | 1999 | 〈嚴復早期的求道之旅─兼論傳統學術性格與思維方式的繼承與轉化〉，《臺大歷史學報》第二十三期（台北：台灣大學歷史系） |
| 4. | 1999 | 〈嚴復《天演論》作意與內涵新詮〉，《臺大歷史學報》第二十四期（台北：台灣大學歷史系） |
| 5. | 1996 | 〈傅斯年學術觀念中的反形式理則傾向〉，《台大歷史學報》第二十期（台北：台灣大學歷史系） |
| 6. | 1996 | The Cosmo-ontological View of Becoming in Ancient Chinese Taoism, 《台大歷史學報》第十九期（台北：台灣大學歷史系） |
| 7. | 1995.08 | 〈從整體性與個體性的融合論中國文化的現代化〉，《錢穆先生紀念館館刊》第三期（台北） |
| 會議論文 |
| 1. | 2005.12.07 | 「現代性之政治反思」國際學術研討會(台北，中央研究院)，受邀評論Daniel Bell的 "Just War and Confucianism：Implications for the Contemporary World"一文 |
| 2. | 2005.11.17 | 「北京論壇」史學分論壇(北京，北京大學)，發表〈朱子的世界秩序觀之構成方式：朱子的天人關係思想析論〉一文 |
| 3. | 2005.09.01 | International Conference on Confucianism: Retrospect and Prospect （加拿大，多倫多大學），發表〈朱子之歷史思想〉（The Historical Thinking of Zhu Xi） |
| 4. | 2005.09.01 | “朱子之歷史思想（The Historical Thinking of Zhu Xi）”，International Conference on Confucianism: Retrospect and Prospect （Torento:University of Toronto, 2005.9.1-2.） |
| 5. | 2005.08.06 | 〈陽明的氣化世界觀與其核心思想析論〉，「東亞近世世界觀的發展」 國際學術會議（台北：台灣大學，2005.8.6） |
| 6. | 2005.08.06 | 「東亞近世世界觀的發展」國際學術會議（台北，台灣大學），發表〈陽明的氣化世界觀與其核心思想析論〉一文 |
| 7. | 2005.08 | 「東亞近世世界秩序觀的發展」國際學術會議（台北：臺大東亞文明研究中心）籌備人 |
| 8. | 2005.05.04 | 〈朱子的認識方式及其現代詮釋〉，「西方的詮釋，中國的回應」國際學術研討會（香港：香港中文大學中國哲學與文化研究中心，2005.5.3-5） |
| 9. | 2005.05.03-05 | 「西方的詮釋，中國的回應」國際學術研討會（香港：香港中文大學），發表〈中西認識方式的基本差異，以宋人的天理觀為例〉一文 |
| 10. | 2005.04.23 | 〈朱子的認知方式析論〉，「東亞傳統思維方式與學術語言的基本特性圓桌型學術會議」（台北：東亞文明研究中心，2005.4.22-23） |
| 11. | 2005.04 | 「東亞傳統斯維方式與學術語言的基本特性」國際學術會議（台北：臺大東亞文明研究中心）籌備人 |
| 12. | 2005.01.28 | 「中國文學歷史與思想中的觀念變遷國際學術研討會」（台北，台灣大學），受邀評論施耐德(Axel Schneider)的 “The one and the many: A classicist reading of China's tradition and its role in the modern world"一文 |
| 13. | 2004.12.20-23 | 「香港中文大學的當代儒者——錢穆、唐君毅、牟宗三、徐復觀」國際學術會議 （香港，香港中文大學），發表〈內在理路與現代詮釋：論現代儒學內部的兩條路線之爭〉 |
| 14. | 2004.12.20-23 | 〈錢穆先生學術的現代意義〉，「香港中文大學的當代儒者——錢穆、唐君毅、牟宗三、徐復觀」國際學術會議 （香港：香港中文大學，2004.12.20-23） |
| 15. | 2004.12.04-06 | 「公私領域新探：東亞觀點與西方之比較」國際學術研討會（台北，臺灣大學），擔任主持人兼評論人，受邀評論黃克武研究員的〈近代中國私領域觀念的崛起與限制〉一文 |
| 16. | 2004.11.21 | 「東亞歷史上的『天下』與『中國』概念學術研討會」（台大東亞文明中心），擔任主持人 |
| 17. | 2004.11.13 | 「 第二屆國際青年學者漢學會議」（清華大學，人文社會學院），擔討論人，受邀評論Prof. Timothy Barker, Jr.的 “Religious Beliefs in the Mid-Han Imperial Ancestor Rituals: The Hanshu ‘Wei Xian Zhuan’” |
| 18. | 2004.09.16-17 | International Conference on the Interaction and Confluence of East Asian Confucianism (日本千里山，關西大學)，發表〈朱子認識觀暨認知方式的基本性質〉 |
| 19. | 2004.09.16 | 〈朱子認識觀暨認知方式的基本性質〉，International Conference on the Interaction and Confluence of East Asian Confucianism (日本千里山：關西大學，2004.916-17) |
| 20. | 2004.09.10 | 「 西方思想對東亞文明的衝擊：跨文化的視野研討會」（臺大），擔任主持人兼評論人，受邀評論Prof. Axel Schneider的 “The one and the many: A classicist reading of China’s tradition and its role in the modern world” |
| 21. | 2004.08.20-21 | 「東亞近世世界觀的形成」國際會議 （台北，臺灣大學），發表〈朱子的世界秩序觀之構成方式〉 |
| 22. | 2004.08.20 | 〈朱子的世界秩序觀之構成方式〉，「東亞近世的世界觀」國際會議 （台北：臺灣大學，2004.8.20-21） |
| 23. | 2004.08 | 「東亞近世世界秩序觀的形成」國際學術會議（台北：臺大東亞文明研究中心）籌備人 |
| 24. | 2004.04.27-28 | Symposium on History, Poetry, and the Classical Tradition (New Haven: Yale University)，發表 “The Basic Characteristics of Zhu Xi’s Worldview” |
| 25. | 2004.04.27 | “The Basic Characteristics of Zhu Xi’s Worldview,” Symposium on History, Poetry, and the Classical Tradition. (New Haven: Yale University, 2004.4.27-28) |
| 26. | 2004.04.01 | “Panel on Taiwan’s Presidential Election” (Illinois, Lake Forest University) |
| 27. | 2004.03.14-15 | 「東亞近世儒學中的經典詮釋傳統」國際學術研討會（台北，臺灣大學），發表〈朱子世界觀的基本特質〉 |
| 28. | 2004.03 | 〈朱子世界觀的基本特質〉，「東亞近世儒學中的經典詮釋傳統」國際學術研討會（台北：臺灣大學，2004.3.14-15） |
| 29. | 2004.01.30 | Asia in the World Workshop (Chicago: University of Chicago, 2004.1.30，發表“The Basic Characteristics of the Neo-Confucian Worldview: An Interpretative Model Focusing on Zhu Xi” |
| 30. | 2004.01 | “The Basic Characteristics of the Neo-Confucian Worldview: An Interpretative Model Focusing on Zhu Xi,” Asia in the World Workshop, (Chicago: University of Chicago, 2004.1.30) |
| 31. | 2000.12.31 | 〈朱子之理氣論：以朱子對北宋經典之詮釋為中心〉，「中國的經典詮釋傳統第十次學術會議」（台北：台灣大學） |
| 32. | 2000.11.29 | 〈嚴復的終極追求〉，「二十世紀前半葉人文社會學術研討會」（台北：東吳大學） |
| 33. | 2000.11.24 | 〈學問之入與出：錢賓四先生與理學〉，「紀念錢穆先生逝世十週年國際學術研討會」（台北：台灣大學） |
| 34. | 2000.06 | 〈中西最高學理的綰合與衝突：嚴復「道通為一」說析論〉，「中國的經典詮釋傳統第八次學術會議」（台北：台灣大學） |
| 35. | 1999.03.10 | 〈嚴復早期的求道之旅〉，「中國的經典詮釋傳統第六次國際學術會議」（台北：台灣大學） |
| 36. | 1998 | Neoromantischer Konfuzinismus und Anti-Rationalismus in China zur Zeit der Vierten-Mai-Bewegung, Der Confuzianismus: Ursprunge-Entwicklungen-Perspektivern,（Leipzig: Leipziger Universitatsverlag GmbH） |
| 37. | 1998 | 〈何謂思想史〉，「何謂歷史學──歷史作為史學理論」研討會（台北） |
| 38. | 1995 | 〈民初大學的理念之原型及其對當前通識教育的啟示－以北大、南開、北洋三校為代表（1912-1928）〉，《傳統中國教育與現代大學通識教育研討會論文集》（台北：台灣大學歷史學系） |
| 論文集論文 |
| 1. | 2005.09 | 〈現代社會與東方思想〉《文明對話下的中國性與歐洲性》（中壢：中央大學，2005） |
| 2. | 2005.09 | 〈人類的三大信仰體系〉《文明對話下的中國性與歐洲性》（中壢：中央大學，2005） |
| 3. | 2000.03 | Historicity, Tradition, Praxis and Tao: A Comparison of the World Views of Zhang Xuecheng and Modern Philosophical Hermeneutics, Classics and Interpretations: The Hermeneutic Traditions in Chinese Culture (New Brunswick: Transaction Publishers) |
| 4. | 1998.05 | 〈明遺民之志節與中國近世學術文化精神〉，《明末清初書法展─文人卷》（台北：何創時基金會） |
| 5. | 1995 | 〈中國現代保守主義之起點：梁漱溟的生生思想及其對西方理性主義的批判（1915-23）〉，《當代儒學論集：傳統與創新》（台北：中研院文哲所） |
| 6. | 1990 | 〈宋史研究指南─學術思想之部〉，《中國史研究指南》（台北：聯經） |
| 書評 |
| 研究報告 |
| 1. | 出版中 | 宋代的心靈世界：「朱子的學說體系」、「歐陽修的生命情懷」… |
| 2. | 出版中 | 「宋儒的世界觀與認知方式之基本特質」 |
| 3. | 出版中 | 「中西世界觀與思維方式的交會」（中國近現代思想史上，中西思想交會時所表現的深層衝突與融合之研究） |
| 4. | 出版中 | 「中國近世世界觀形成與演化」 |
| 5. | 2004-2005 | 臺大東亞文明研究中心，「東亞近世世界觀的發展」 |
| 6. | 2004-2005 | 臺大東亞文明研究中心，「東亞傳統思維方式與學術語言的基本特性」 |
| 7. | 2003-2004 | 與美國芝加哥大學歷史系合作，”The Meaning of the East” |
| 8. | 2003-2004 | 臺大東亞文明研究中心，「宋代世界觀的形成與基本特質」 |
| 9. | 2000-2004 | 教育部追求卓越計畫「東亞近世儒學中的經典詮釋傳統之研究－理學的世界觀與認知方式之基本特質：以朱子的經典詮釋為中心」 |
| 10. | 1998 | 《朱子『近思錄』課程的通識內涵與教學設計》，行政院國家科學委員會研究報告 |
| 11. | 1997 | 《現代中國高等教育思想與實踐及其對當前通識教育之啟示》，行政院國家科學委員會研究報告 |
| 他類論文 |
| 1. | 2000.05.26 | International Conference on the Concept of Time in Chinese Historical Thinking, Commentator, Immanental Human Being in Transcendental Time-Epistemological Basis of Pristine Chinese Historical Consciousness |
| 2. | 2000.01-2004.12 | 教育部追求卓越計畫「東亞近世儒學中的經典詮釋傳統之研究－理學的世界觀與認知方式之基本特質：以朱子的經典詮釋為中心」 |
| 3. | 1997.04.18-19 | Confucianism: Past and Present, Leipzig University, Leipzig, Germany. Paper delivered: Neo-Romantic Confucianism Versus Western Rationalism |
| 4. | 1996.11.08-10 | 38th Annual Conference of the American Association for Chinese Studies, University of Maryland, Maryland. Discussant of the Panel of Cultural Responses and Assertiveness in Modernization Processes in China and Taiwan |
| 5. | 1996.10.10-12 | Conference on the Hermeneutic Traditions in Chinese Culture, Rutgers University. Paper delivered: Historicity, Tradition, Praxis and Tao: A Comparison of The World Views of Zhang Xuecheng and Modern Philosophical Hermeneutics |
| 6. | 1996.09.09-11 | Post-War Taiwan Experience in Historical Perspective, University of Maryland. Discussant of the panel on Issues in Thought |
| 7. | 1996.04 | Affection, Righteousness, and language in Chinese Literature, National Taiwan University. Discussant of the paper on Individuality in Modern Chinese Literature |
| 8. | 1994.07.12 | The International Conference on Modes of Thought in Ancient China, sponsored by Marburg University, Germany, paper delivered: The Metaphysical View of Becoming in Ancient Chinese Taoism |
| 其他著作 |
| 1. | 2005.01 | 《朱子研究書目新編 1900∼2002》（台北：台大出版中心，2004） |
| 2. | 2004.04 | 〈傳統人文學術的未來〉《開放時代》第二期 （廣州，2004.4） |
| 3. | 1999.04 | 〈中西思想與文化史研究線上指南〉 "ON-LINE GUIDE TO THE STUDY OF CHINESE & WESTERN INTELLECTUAL & CULTURAL HISTORY," Internet: http://ccsun57.cc.ntu.edu.tw/~qiaozhe/, 1996.6.26，第一版，1999.4修訂 |
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